Es el único Centro de fauna exótica en Canarias con una cuarentena de nivel 3 de Bioseguridad certificado. La certificación ha sido emitida por TDI, entidad acreditada por la ENAC (Entidad Nacional de Acreditación. Declarada, según el Real Decreto 1715 de 2010, del estado español, como el único organismo dotado de potestad pública para otorgar acreditaciones de acuerdo con lo establecido en el Reglamento Europeo (CE) n.º765/2008).
Sus instalaciones además están autorizadas por el Gobierno de Canarias como centro de depósito de ejemplares de taxa incluidos en el Real Decreto 630/2013 de 2 de agosto, que regula el Catálogo Español de Especies Exóticas Invasoras.
El BOE nº 194 de 15 de agosto de 2017 publica la Resolución de 27 de julio de 2017, de la Secretaría de Estado de Comercio, por la que se publica el Convenio de colaboración con la Fundación Neotrópico, para el depósito y destino de especímenes interceptados y decomisados de fauna exótica.
La Fundación Neotrópico posee además convenios de colaboración en materia de especies exóticas y emergencias 24 horas para el asesoramiento, la detección y retirada inmediata de ejemplares con las Autoridades Competentes.